单细胞ATAC(10x)测序项目（JJ20250045）采购公告



：2025-06-10 18:39:47阅读量：108 次

































项目名称

单细胞ATAC(10x)测序项目

项目编号

JJ20250045





公示开始日期

2025-06-10 18:39:47

公示截止日期

2025-06-16 09:00:00





采购单位

西北农林科技大学

付款方式

1.所有货物经甲乙双方验收合格并签署验收单，甲方原则上在乙方提供全额发票（国产设备须提供增值税专用发票）及供货清单后10个工作日内通过银行电汇方式付给乙方全额货款。乙方在合同签订前缴纳中标金额的5%作为履约保证金，验收合格后退还。





联系人



中标后在我参与的项目中查看



联系电话



中标后在我参与的项目中查看







签约时间要求

成交后3个工作日内

计划工期/到货期/服务期

合同签订后，乙方收到检测样品20个工作日内出具服务数据





预算





￥ 250,000









供应商资质要求



符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件







收货地址























采购清单1











采购明细

采购数量

计量单位

所属分类





单细胞ATAC(10x)测序项目

25

项















品牌







规格型号







预算



￥ 10,000









技术参数及配置要求/服务明细

服务平台要求：1基于10x Genomics平台的单细胞捕获技术，通过制备细胞核悬液，用Tn5转座酶对染色质开放区的DNA进行剪切获得单细胞水平的染色质开放情况。服务数据产出质量和数量要求：1)文库峰形呈三峰状,三个主峰介于100bp-1000bp；2)DNA文库浓度≥1.5nM；3)文库测序数据量≥400M reads；4)Q30>85％；5)测序数据基因组比对率≥80%；6)目标捕获细胞数浮动范围在20%以内；7)Fraction of high-quality fragments overlapping peaks > 25%；8)Median high-quality fragments per cell > 10000；9)TSS sc{**e > 4；10)每个样品细胞捕获数量8000-13000之间，鉴定的细胞类型正常，包含组织实质细胞和免疫细胞等类群，与已发表文献无很大偏差；服务分析要求1）标准分析：a、测序数据质控：各个样本测序数据质控（reads数、测序饱和度等）与Cell Ranger分析结果质控（Estimated number of cells，Median high-quality fragments per cell，Fraction of high-quality fragments overlapping peaks等）；b、Peak对应的基因和区域注释；c、Peak的可视化分析及展示：基因热图、基因Feature plot图、基因Dot plot图等；d、细胞Cluster/样本间peak差异分析：peak差异火山图、peak表达MA图；e、功能富集分析：peak注释基因的GO功能富集分析、KEGG功能富集分析；f、细胞聚类图：细胞群体cluster聚类、t-SNE聚类及可视化，基因对应peak的可视化图；g、细胞注释图2）高级分析内容Motif富集分析，Promoter富集分析，GSEA功能富集分析，GSVA功能富集分析，Cluster/cell/sample间相关性分析，多样本整合分析，WGCNA分析，单细胞转录组-单细胞ATAC相关性分析(需要单细胞转录组数据)等。3）定制化分析内容a、提供邮箱、电话、群、线上线下会议等多种方式进行沟通和数据分析探讨；b、利用公司单细胞测序行业专业优势，及时掌握领域研究进展和情报，遇到严峻竞争事态时，向甲方提供预警和差异化研究方案；c、结合公司已有的领域知识和单细胞数据分析经验，对个性化数据分析结果进行解读研判，并制定下一步数据分析方案；d、对于文章投递过程中审稿人的提问及时协助解答，对于补充数据分析按要求进行数据分析并及时提供分析结果；e、免费进行其它合理的定制化数据分析。









售后服务

商品承诺:送货上门/安装调试/技术培训;免费售后分析两年;



















西北农林科技大学







2025-06-10 18:39:47



























附件下载：





投标须知.doc











本项目采购需遵照《重庆大学采购管理办法》、《重庆大学校级采购实施细则》、《重庆大学零星采购实施细则》执行，适用“有效最低价成交原则”，成交后将采用电子签章的方式签要对应的

《重庆大学货物采购合同书》，请各位供应商仔细阅读本项目采购公告、《重庆大学货物采购合同书》、《云采通电子印章使用规则》，确认其报价及后续履约完全符合上述要求。成交后，供应商以任何理由不签署合同或者签署合同后不按照合同履约的，均将列为不诚信供应商，一至三年内禁止参加重庆大学采购活动。





我已阅读并同意《重庆大学货物采购合同书》、《云采通电子印章使用规则》、《重庆大学采购管理办法》、《重庆大学校级采购实施细则》、《重庆大学零星采购实施细则》